Société de protection des plantes du Québec, 112e Assemblée annuelle (2021). « L’intelligence artificielle au service de la phytoprotection » Québec Society for the Protection of Plants, 112th Annual meeting (2021). “Using artificial intelligence in phytoprotection”

V. Jalali Javaran^1,2, P. Moffett², M.-L. Fall¹ Grapevine (Vitis vinifera L.) has a significant impact on the economy of many countries. In recent years, the grape and wine industry has been facing outbreaks of viral diseases. Although high-throughput sequencing (HTS) has been used extensively for virus detection and virus evolution in the past decade, the potential of nanopore sequencing has not been extended in this area. To help the grapevine industry to design an efficient management tool, rapid and early detection tools are needed. MinION is a low-cost and disposable sequencer that can be easily used without the need for costly advanced equipment. For using nanopore sequencing as a diagnostic tool, total RNA and dsRNA extraction methods and the different library preparation kits are compared. Our preliminary results from dsRNA libraries were comparable with short-read sequencing results from Illumina Miseq sequencer. Although several challenges, such as error correction and base modification detection, need to be resolved, the valuable potential of nanopore technology for massively parallel sequencing (MPS) should not be overlooked. With early detection, it is possible to identify the viral threat and then develop a novel tool to trigger disease resistance by using RNA interference (RNAi) through the exogenous application of double-stranded RNAs (dsRNAs) in V. vinifera. The dsRNAs will be synthesized in vivo (through Pseudomonas syringae production system) and in vitro (chemically-based) methods and be placed into clay nanosheets (Bioclay). Then these RNA-Bioclay complexes will be transferred to grapevines through topical application, trunk injection, and petiole absorption. The delivery and activity of these RNA molecules in field conditions will be analyzed by biological and biotechno-logical methods. S. Cloutier¹, J. Legault², A. Bédard³, M.C. Paré¹ La gale commune, principalement causée par Streptomyces scabiei, est une maladie importante qui dégrade la qualité des pommes de terre (Solanum tuberosum). L’utilisation de fumigants peut atténuer les symptômes de la maladie, mais le développement d’alternatives efficaces et à plus faibles impacts environnementaux demeure nécessaire. Les objectifs de cette étude sont d’évaluer in vitro l’effet d’extraits d’écorces sur la survie de trois souches de S. scabiei et de déterminer, en serres, l’effet des extraits les plus efficaces sur les symptômes de la gale commune et la croissance de cultivars de pomme de terre. In vitro, le type d’extrait a eu un effet significatif sur la survie de S. scabiei, avec des concentrations inhibitrices inférieures pour les extraits de conifères (IC50 < 48 μg mL^-1) comparativement aux feuillus (IC50 > 100 μg mL^-1). Les trois souches de S. scabiei ont réagi de manière similaire à l’ajout des extraits. En serres, des doses de 0,033 et 0,065 kg m^-2 en extraits de conifères ont permis de réduire significativement la sévérité de la gale de 48 % sans affecter négativement la croissance de Solanum tuberosum, et ce, pour tout cultivar. Ces extraits pourraient représenter une alternative aux fumigants nocifs utilisés pour réduire la gale commune. J. Yergeau^1,2, G. Charron³, H. Van der Heyden³, C. Beaulieu¹, P. Tanguay² Les productions d’arbres de Noël sont vulnérables aux maladies infectieuses, dû à leur faible diversité génétique et à une grande promiscuité des individus, ce qui les désavantage lors de l’émergence d’un pathogène. Il existe peu d’informations sur l’identité des agents pathogènes du genre Phytophthora causant la pourriture racinaire présents au Québec, d’où l’intérêt de mon projet. L’identification des espèces a été réalisée avec des échantillons de sols et de racines d’arbres malades et sains. La …