Résumés
Résumé
Un inventaire des maladies racinaires du soya causées par des champignons et des oomycètes a été réalisé en 2014 et 2015 dans 80 champs situés en Montérégie et 4 au Centre-du-Québec. Douze plantules au stade de deux feuilles trifoliées ont été prélevées par champ pour évaluer l’état sanitaire de leurs racines (indice racinaire) selon une échelle de 1 à 5 (1 = belles racines abondantes ; 5 = nécroses et peu de racines), et pour révéler dans ces racines, à l’aide de techniques de mise en culture, la présence de champignons et d’oomycètes pathogènes. L’indice racinaire moyen pour l’ensemble des champs était de 2,6 en 2014 et 3,2 en 2015. Des espèces de Pythium et de Fusarium étaient présentes dans presque 100 % des champs chaque année, alors que Rhizoctonia solani et Thielaviopsis basicola ont été plus abondants en 2015 (88 % des champs) qu’en 2014 (52 %). Phytophthora sojae n’a été isolé d’aucune racine, mais l’a été à partir des sols de 37 % des champs. Les espèces de Fusarium les plus fréquentes étaient F. solani, F. oxysporum et F. equiseti, présentes dans au moins 60 % des champs. La méthode d’analyse « stepwise » a sélectionné trois facteurs pour expliquer la variation de l’indice racinaire, dont deux ont montré des différences significatives entre leurs niveaux, soit le type de semence (indice plus élevé pour non-OGM que pour OGM) et le nombre d’années en culture de soya au cours des quatre dernières années (indice augmentant avec le nombre d’années). Le travail du sol a été le seul facteur sélectionné pour expliquer la variation des Fusarium totaux (somme diminuant avec l’intensité du travail de sol).
Mots-clés :
- inventaire,
- maladies,
- racines,
- soya,
- Glycine max,
- Fusarium spp.,
- Thielaviopsis basicola,
- Phytophthora sojae,
- Rhizoctonia solani,
- Pythium spp.,
- pratiques culturales
Abstract
A survey on soybean root diseases caused by fungi and oomycetes was conducted in 2014 and 2015 in 80 fields in Montérégie and 4 fields in Centre-du-Québec. Twelve seedlings at two-trifoliate-leaf stage were collected per field to assess their root health (root index) on a scale of 1 to 5 (1 = healthy abundant roots, 5 = necrosis and few roots), and to reveal in theses roots, by plating techniques, the presence of pathogenic fungi and oomycetes. The average root index for all fields was 2.6 in 2014 and 3.2 in 2015. Pythium and Fusarium species were present in almost 100% of the fields each year, while Rhizoctonia solani and Thielaviopsis basicola were more abundant in 2015 (88% of the fields) than in 2014 (52%). Phytophthora sojae was not isolated from any root, but was isolated from soils in 37% of the fields. The most common Fusarium species were F. solani, F. oxysporum and F. equiseti, found in at least 60% of the fields. The stepwise-analysis method selected three factors to explain the variation of root index, two of which showed significant differences between their levels, namely the type of seeds (higher index for non-GMOs than for GMOs). and the number of years in soybean crop over the past four years (index increasing with the number of years). Tillage was the only factor selected to explain the variation of the sum of Fusarium isolates (sum decreasing with the intensity of tillage).
Keywords:
- survey,
- root diseases,
- soybean,
- Glycine max,
- Fusarium spp.,
- Thielaviopsis basicola,
- Phytophthora sojae,
- Rhizoctonia solani,
- Pythium spp.,
- crop management
Parties annexes
Références
- Agricultural, consumer, and environmental Sciences (ACES). 2015. Estimates of soybean yield reductions caused by diseases in the United States, 1996-2014. Site Internet maintenu par le Crop Science Extension and Outreach, University of Illinois. [En ligne] http://extension.cropsciences.illinois.edu/fieldcrops/diseases/yield_reductions.php
- Bailey, K.L., L. Couture, B.D. Gossen, R.K. Gugel et R.A.A. Morrall. 2004. Maladies des grandes cultures au Canada (1re éd.). Société Canadienne de phytopathologie, Saskatoon, SK, Canada. 332 p.
- Bennett, D. 2010. Soybeans: black root rot increases. Delta FarmPress. [En ligne] http://www.deltafarmpress.com/soybeans/soybeans-black-root-rot-increases
- Bourdages, J.V., S. Marchand, S. Rioux et F.J. Belzile. 2006. Diversity and prevalence of Fusarium species from Quebec barley fields. Can. J. Plant Pathol. 28 : 419-425.
- Cook, R.J. 1992. Wheat root health management and environmental concern. Can. J. Plant Pathol. 14 : 76-85.
- Cook, R.J. 2003. Take-all of wheat. Physiol. Mol. Plant Pathol. 62 : 73-86.
- Cook, R.J. 2006. Toward cropping systems that enhance productivity and sustainability. Proc. Natl. Acad. Sci. 103 : 18389–18394.
- Fehr, W.R., C.E. Caviness, D.T. Burmood et J.S. Pennington. 1971. Stage of development descriptions for soybeans, Glycine max (L.) Merrill. Crop Sci. 11 : 929-931.
- Huber, D.M. et T.S. McCay-Buis. 1993. A multiple component analysis of the take-all disease of cereals. Plant Dis. 77 : 437-447.
- Jeffers, S.N. et S.B. Martin. 1986. Comparison of two media selective for Phytophthora and Pythium species. Plant Dis. 70 : 1038-1043.
- Krupinsky, J.M., K.L. Bailey, M.P. McMullen, B.D. Gossen et T.K. Turkington. 2002. Managing plant disease risk in diversified cropping systems. Agron. J. 94 : 198-209.
- Labrie, G., A.-È. Gagnon, S. Rioux et J. de Almeida. 2017. Impacts des néonicotinoïdes et des fongicides foliaires sur les maladies, les ravageurs des semis, le puceron du soya et les ennemis naturels ainsi que sur les paramètres agronomiques du soya au Québec. Rapport présenté au Programme Prime-Vert, volet 3.2, du ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec. 14 p.
- Lévesque, C.A., T. Barasubiye, A. Tenuta, S. Rioux, T.R. Anderson, K.A. Seifert, E. Cober et A.G. Xue. 2005. Caractérisation des principaux agents pathogènes de la pourriture des racines chez le soja dans l’ouest du Québec et l’est de l’Ontario. Rapport présenté à La Fédération des producteurs de cultures commerciales du Québec et l’Association des producteurs de soja de l’Ontario. 35 p.
- Lévesque, C.A. et J.E. Rahe. 1992. Herbicide interactions with fungal root pathogens, with special reference to glyphosate. Annu. Rev. Phytopathol. 30 : 579-602.
- Nelson, P.E., T.A. Toussoun et W.F.O. Marasas. 1983.Fusarium species: an illustrated manual for identification. Pennsylvania State University Press, State college, PA, USA. 193 p.
- Nirenberg, H.I. 1981. A simplified method for identifying Fusarium spp. occurring on wheat. Can. J. Bot. 59 : 1599-1609.
- Pankhurst, C.E., H.J. McDonald et B.G. Hawke. 1995. Influence of tillage and crop rotation on the epidemiology of Pythium infections on wheat in a red-brown earth of South Australia. Soil Biol. Biochem. 27 : 1065-1073.
- Paulitz, T.C., R.W. Smiley et R.J. Cook. 2002. Insights into the prevalence and management of soilborne cereal pathogens under direct seeding in the Pacific Northwest, U.S.A. Can. J. Plant Pathol. 24 : 416-428.
- Pouleur, S. et A. Comeau. 2011. Effet des rotations et des travaux de sol sur les maladies des racines de différentes cultures commerciales, phases I et II. Rapport de recherche présenté à La Fédération des producteurs de cultures commerciales du Québec. 140 p.
- Rashid, A., S.F. Hwang, H.U. Ahmed, G.D. Turnbull, S.E. Strelkov et B.D. Gossen. 2013. Effects of soil-borne Rhizoctonia solani on canola seedlings after application of glyphosate herbicide. Can. J. Plant Sci. 93 : 97-107.
- Roget, D.K. 1995. Decline in root rot (Rhizoctonia solani AG-8) in wheat in a tillage and rotation experiment at Avon, South Australia. Aust. J. Exp. Agric. 35 : 1009-1013.
- Sanogo, S., X.B. Yang et H. Scherm. 2000. Effects of herbicides on Fusarium solani f. sp glycines and development of sudden death syndrome in glyphosate-tolerant soybean. Phytopathology 90 : 57-66.
- SAS Institute, Inc. 2015. Version 9.4, SAS Institute, Inc., Cary, NC, USA.
- Schmitthenner, A.F. 2000.Phytophthora rot of soybean. Plant Health progress. [En ligne] http://www.plantmanagementnetwork.org/pub/php/management/phytophthora/
- Schroeder, K.L. et T.C. Paulitz. 2006. Root diseases of wheat and barley during the transition from conventional tillage to direct seeding. Plant Dis. 90 : 1247-1253.
- van Bniggen, A.H.C. et A.J. Termorskuizen. 2003. Integrated approaches to root disease management in organic farming systems. Australas. Plant Pathol. 32 : 141-156.
- Vega-Sanchez, M.E., M.G. Redinbaugh, S. Costanzo et A.E. Dorrance. 2005. Spatial and temporal expression analysis of defense-related genes in soybean cultivars with different levels of partial resistance to Phytophthora sojae. Physiol. Mol. Plant Pathol. 66 : 175-182.
- Xue, A.G., G. Marchand, Y. Chen, S. Zhang, E.R. Cober et A. Tenuta. 2015. Races of Phytophthora sojae in Ontario, Canada, 2010–2012. Can. J. Plant Pathol. 37 : 376-383.