Société de protection des plantes du Québec. 107e Assemblée annuelle (2015) Symposium Québec Society for the Protection of Plants. 107th Annual Meeting (2015) Symposium

F. Belzile, E. Iquira et M. Bastien. Département de phytologie et Institut de biologie intégrative et des systèmes, Université Laval, Québec (Québec), Canada G1V 0A6 Au cours des dernières années, le soja a connu une croissance exceptionnelle au Québec et au Canada, au point de constituer la troisième culture en importance au pays en 2014. Dans les conditions climatiques relativement fraîches qui prévalent au Québec, certaines pourritures sont particulièrement problématiques. C’est le cas notamment de la pourriture à sclérotes, ou sclérotiniose, causée par le Sclerotinia sclerotiorum. Comme les moyens de lutte chimique ou biologique sont souvent trop coûteux ou ne sont pas suffisamment efficaces, la résistance génétique demeure la méthode de lutte la plus attrayante. Pour le sélectionneur, cependant, le développement de variétés dotées d’une résistance supérieure se bute à certains défis. D’une part, seule une résistance partielle a été documentée chez le soja et celle-ci repose sur l’action de nombreux gènes à effet modeste. D’autre part, l’incidence et la sévérité de la maladie son très variables d’une année à une autre, ce qui rend difficile l’évaluation de la résistance au champ. Pour surmonter ces difficultés, nous avons cherché à identifier des régions génomiques, ou quantitative trait loci (QTL), qui sont fortement associées à la résistance au S. sclerotiorum. Des marqueurs moléculaires situés dans ces régions permettraient de sélectionner les lignées les plus résistantes sur la base de leur bagage génétique plutôt que sur la base de leur comportement au champ. Pour ce faire, nous avons caractérisé en détail deux collections de lignées de soja, l’une étant composée de lignées élites représentatives de ce qui est cultivé au Québec et l’autre comprenant surtout des lignées exotiques, incluant des accessions rapportées comme étant de bonnes sources de résistance à la sclérotiniose. Dans les deux cas, ces lignées de soja ont été caractérisées non seulement en ce qui a trait à leur résistance à la sclérotiniose, mais aussi au plan de la génétique à l’aide de milliers de marqueurs SNP répartis sur l’ensemble du génome. Fait intéressant, certaines des lignées exotiques présentaient un degré de résistance supérieur à ce qu’il y avait de mieux au sein des lignées élites. Ensuite, nous avons réalisé des analyses d’association pangénomique, ou GWAS (Genome-Wide Association Analysis). Ces analyses ont permis d’identifier de trois à quatre QTL dans chaque collection, auxquels on pouvait attribuer individuellement entre 7 et 21 % de la résistance partielle observée. Par ailleurs, les QTL identifiés chez les lignées exotiques étaient, à de rares exceptions près, différents de ceux repérés chez les lignées élites. Dans le cas d’un QTL en particulier, nous avons fait la démonstration que la sélection de plantes sur la base du marqueur SNP associé à cette résistance permettait de sélectionner des plantes dotées d’une résistance supérieure. Cela suggère qu’il soit possible d’accroître la résistance chez le soja cultivé au Québec en y introduisant les QTL de résistance qui sont présents chez les lignées exotiques à l’aide d’une approche de sélection assistée par marqueurs. R.C. Hamelin. Centre de foresterie des Laurentides, Ressources naturelles Canada, Québec (Québec), Canada G1V 4C7; Department of Forest and Conservation Sciences, University of British Columbia, Vancouver (Colombie-Britannique), Canada V6T 1Z4 Nos forêts sont sans cesse sous la menace d’agents pathogènes et de ravageurs. Les espèces exotiques envahissantes, les changements climatiques et les activités anthropiques contribuent à faire augmenter le risque d’épidémies. Nous sommes à l’aube d’une nouvelle ère qui promet de révolutionner nos approches en protection des forêts. La génomique est en train de bouleverser des domaines aussi diversifiés que la médecine, l’agriculture, l’environnement et la foresterie. En décodant les génomes des …