Abstracts
Résumé
L’analyse des marqueurs microsatellites et d’allozymes chez différentes espèces de poissons de fond (morue, flétan du Groenland et sébaste) et de crustacés (crabe des neiges et crevette nordique) montre que les organismes du Saguenay et du Saint-Laurent appartiennent aux mêmes populations. La seule différenciation génétique est observée au locus Pan I chez la morue. Cette différenciation pourrait toutefois être causée par la sélection, qui agirait dans le fjord du Saguenay, plutôt que par l’isolement génétique de la population. Les données complémentaires disponibles pour les poissons de fond (composition élémentaire des otolithes, morphométrie et faune parasitaire) montrent que les individus capturés dans le Saguenay diffèrent de ceux du Saint-Laurent. Ces différences suggèrent que les individus du Saguenay et du Saint-Laurent passent la majeure partie de leur cycle vital dans des environnements différents. Considérant la très faible survie larvaire observée dans le fjord, cette revue suggère que les populations de poissons de fond du Saguenay constituent des populations puits, dont le recrutement dépend de l’apport de juvéniles depuis le Saint-Laurent. Une fois les individus installés dans le Saguenay, ils y passent la majorité de leur vie. Même si nous ne possédons pas de données complémentaires pour les crustacés, il est possible que le même mécanisme opère chez ces espèces.
Mots Clés:
- connectivité,
- allozyme,
- microsatellite,
- Pan I,
- Gadus morhua,
- Reinhardtius hippoglossoides,
- Sebastes spp.,
- Chionoecetes opilio,
- Pandalus borealis
Abstract
Microsatellite and allozyme analyses on various species of bottom fishes (cod, Greenland halibut and redfish) and crustaceans (snow crab, northern shrimp) show that individuals from the Saguenay Fjord and from the St. Lawrence belong to the same populations. The only genetic difference observed is at the Pan I locus of cod. This differentiation may be caused by selection that would act in the Saguenay Fjord, rather than due to the genetic isolation of the population. Complementary data available for bottom fish (elemental composition of otoliths, body morphometry, and parasite fauna) show clear differences between the Saguenay and the St. Lawrence. These differences suggest residence of individuals in the Saguenay and the St. Lawrence for a large proportion of their life cycle. Considering the low larval survival observed in the fjord, this review suggests that the bottom fish populations from the Saguenay represent sink populations whose recruitment depends largely or solely on migration of juveniles from the St. Lawrence. Although there are no complementary data for crustacean species, it is possible that migration and residence are processes operating for those species as well.
Keywords:
- connectivity,
- allozyme,
- microsatellite,
- Pan 1,
- Gadus morhua,
- Reinhardtius hippoglossoides,
- Sebastes spp.,
- Chionoecetes opilio,
- Pandalus borealis
Appendices
Références bibliographiques
- ARTHUR J.R. et E. ALBERT (1993). Use of parasites for separating stocks of Greenland halibut (Reinhardtius hippoglossoides) in the Canadian Northwest Atlantic. Can. J. Fish. Aquat. Sci., 50, 2175-2181.
- BELKHIR K., P. BORSA, J. GOUDET, L. CHIKHI et F. BONHOMME (1996-2004). GENETIX 4.05, logiciel sous WindowsTM pour la génétique des populations. Laboratoire Génome, Populations, Interactions, CNRS UMR 5000, Université de Montpellier II, Montpellier, France.
- BOURGEOIS A. (1993). Évaluation de l’exploitation du sébaste atlantique (Sebastes mentella) par la pêche sportive hivernale sur le Saguenay, saison 1990-91. Mémoire de maîtrise, Univ. du Québec à Chicoutimi, Canada, 73 p.
- BROOKER A.L., D. COOK, P. BENTZEN, J.M. WRIGHT et R.W. DOYLE (1994). Organization of microsatellites differs between mammals and cold-water teleost fish. Can. J. Fish. Aquat. Sci., 51, 1958-1966.
- CAMPANA S.E., G.A. CHOUINARD, J.M. HANSON, A. FRÉCHET et J. BRATTEY (2000). Otolith elemental fingerprints as biological tracers of fish stocks. Fish. Res., 46, 343-357.
- CAMPANA S.E., A.E. VALENTIN, J.-M. SÉVIGNY et D. POWER (2007). Tracking seasonal migrations of redfish (Sebastes spp.) in the Gulf of St. Lawrence using otolith elemental fingerprints. Can J. Fish. Aquat. Sci., 64, 6-18.
- DIONNE J.-C. et S. OCCHIETTI (1996). Aperçu du quaternaire à l’embouchure du Saguenay, Québec. Geogr. Phys. Quat., 50, 5-34.
- EL MOUSADIK A. et R.J. PETIT (1996). High level of genetic differentiation for allelic richness among populations of the argan tree [Argania spinosa (L.) Skeels] endemic to Morocco. Theor. Appl. Genet., 92, 832-839.
- GOUDET J. (2001). FSTAT, a program to estimate and test gene diversities and fixation indices (version 2.9.3.2). Updated from Goudet 1995. FSTAT (Version 1.2): a computer program to calculate F-statistics. J. Hered., 86, 485-486.
- GUINAND B., C. LEMAIRE et F. BONHOMME (2004). How to detect polymorphisms undergoing selection in marine fishes? A review of methods and case studies, including flatfishes. J. Sea Res., 51, 167-182.
- JØRSTAD K.E., P.A. PRODOHL, A.-L. AGNALT, M. HUGHES, A.P. APOSTOLIDIS, A. TRIANTAFYLLIDIS, E. FARESTVEIT, T.S. KRISTIANSEN, J. MERCER et T. SVÅSAND (2004). Sub-arctic populations of European lobster, Homarus gammarus, in northern Norway. Environ. Biol. Fish., 69, 223-231.
- KNUTSEN H., P.E. JORDE, O.T. ALBERT, A.R. HOELZEL et N.C. STENSETH (2007). Population genetic structure in the North Atlantic Greenland halibut (Reinhardtius hippoglossoides): influenced by oceanic current systems? Can. J. Fish. Aquat. Sci., 64, 857-866.
- LOUCKS R.H. et R.E. SMITH-SINCLAIR (1975). Report on the physical oceanography of the Saguenay fjord. Rapport non publié, Chemical Oceanography Division of Bedford Institute of Oceanography, Dartmouth, Nova Scotia. 77 p.
- MACKENZIE K. et P. ABAUNZA (1998). Parasites as biological tags for stock discrimination of marine fish: a guide to procedures and methods. Fish. Res., 38, 45-56.
- MILLER K.M., K.D. LE et T.D. BEACHAM (2000). Development of tri- and tetranucleotide repeat microsatellite loci in Atlantic cod (Gadus morhua). Mol. Ecol., 9, 238-239.
- MPO 2007. La pêche sportive hivernale dans le fjord du Saguenay en 2006. Secrétariat canadien de consultation scientifique du MPO, Avis scientifique. 2007/001.
- NIELSEN E.E., B.R. MACKENZIE, E. MAGNUSSEN et D. MELDRUP (2007). Historical analysis of Pan I in Atlantic cod (Gadus morhua): temporal stability of allele frequencies in the southeastern part of the species distribution. Can J. Fish. Aquat. Sci., 64, 1448-1455.
- O’REILLY P.T., M.F. CANINO, K.M. BAILEY et P. BENTZEN (2000). Isolation of twenty low stutter di- and tetra nucleotide microsatellites for population analysis of walleye pollock and other gadoids. J. Fish Biol., 56, 1074‑1086.
- OUELLET P. et J.-P. ALLARD (2006). Vertical distribution and behaviour of shrimp Pandalus borealis larval stages in thermally stratified water columns: laboratory experiment and field observations. Fish. Oceanogr., 15, 373-389.
- PERRIN C., S.R. WING et M.S. ROY (2004). Effects of hydrographic barriers on population genetic structure of the sea star Coscinasterias muricata (Echinodermata, Asteroidea) in the New Zealand fiords. Mol. Ecol., 13, 2183-2195.
- PUEBLA O., É. PARENT et J.-M. SÉVIGNY (2003). New microsatellite markers for the snow crab Chionoecetes opilio (Brachyura: Majidae). Mol. Ecol., 3, 644-646.
- PUEBLA O., J.-M. SÉVIGNY, B. SAINTE-MARIE, J.‑C. BRÊTHES, A.D. BURMEISTER, E. DAWE et M. MORIYASU (2008). Population genetic structure of the snow crab (Chionoecetes opilio) at the Northwest Atlantic scale. Can. J. Fish. Aquat. Sci., 65, 425-436.
- RICE W. (1989). Analyzing tables of statistical tests. Evolution, 43, 223-225.
- ROQUES S., J.-M. SÉVIGNY et L. BERNATCHEZ (2002). Genetic structure of deep-water redfish, Sebastes mentella, populations across the North Atlantic. Mar. Biol., 140, 297-307.
- SAINTE-MARIE B., V. LAPOINTE, D. ARCHAMBAULT et R. DUFOUR (1992). Distribution spatiale et structure de taille du crabe des neiges, Chionoecetes opilio (O. Fabricius), dans le fjord du Saguenay. Rapp. man. can. sci. halieut. aquat., 2156, 12 p.
- SARVAS, T.H. et S.-E. FEVOLDEN (2005). Pantophysin (Pan I) locus divergence between inshore vs offshore and northern vs southern populations of Atlantic cod in the north-east Atlantic. J. Fish Biol., 67, 444-469.
- SÉVIGNY J.-M. (1994). Variation génétique chez le flétan du Groenland (Reinhardtius hippoglossoides) et la crevette nordique (Pandalus borealis) du fjord du Saguenay. Dans : Le fjord du Saguenay : un milieu exceptionnel de recherche.Sévigny J.-M. et C.M. Couillard (Éditeurs). Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat., 2270, v + 118 p., pp. 50-63.
- SÉVIGNY J.-M. et C.M. COUILLARD (Éditeurs) (1994). Le fjord du Saguenay: un milieu exceptionnel de recherche. Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat. 2270, v + 118 p.
- SÉVIGNY J.-M., G. ROSS, D. ARCHAMBAULT et É. PARENT (1992). Genetic variation in Greenland halibut (Reinhardtius hippoglossoides) from the Saint Lawrence system and the Northwest Atlantic. CAFSAC. Res. Doc., 92/99.
- SÉVIGNY J.-M., L. SAVARD et D.G. PARSONS (2000). Genetic characterization of the northern shrimp Pandalus borealis, in the Northwest Atlantic. J. Northwest Atl. Fish. Sci., 27, 1-15.
- SHAW J., P. GAREAU et R.C. COURTNEY (2002). Palaeogeography of Atlantic Canada 13–0 kyr. Quat. Sci. Rev., 21, 1861-1878.
- SIROIS P., G. DIAB, A.-L. FORTIN, S. PLOURDE et N. MÉNARD. Recrutement des poissons dans le fjord du Saguenay. Rev. Sci. Eau (ce numéro).
- SKARSTEIN T.H., J.-I. WESTGAARD et S.-E. FEVOLDEN (2007). Comparing microsatellite variation in north-east Atlantic cod (Gadus morhua L.) to genetic structuring as revealed by the pantophysin (Pan I) locus. J. Fish Biol., 70 (Suppl. C), 271–290.
- SKÖLD M., S.R. WING et P.V. MLADENOV (2003). Genetic subdivision of a sea star with high dispersal capability in relation to physical barriers in a fjordic seascape. Mar. Ecol. Prog. Ser., 250, 163-174.
- SUNEETHA K.B. et G. NAeVDAL (2001). Genetic and morphological stock structure of the pearlside, Maurolicus muelleri (Pisces, Sternoptychidae), among Norwegian Fjords and offshore area. Sarsia, 86, 191-201.
- SWAIN D.P. et C.J. FOOTE (1999). Stocks and chameleons: the use of phenotypic variation in stock identification. Fish. Res., 43, 113-128.
- TALBOT A. (1992). Description de la pêche sportive hivernale dans le fjord du Saguenay et de ses effets potentiels sur la ressource. Rapp. présenté à Environnement Canada, 134 p.
- TALBOT A. et J.-M. SÉVIGNY (1994). Caractéristiques de la population de flétan du Groenland (Reinhardtius hippogloissoides) du fjord du Saguenay. Dans : Le fjord du Saguenay: un milieu exceptionnel de recherche. Sévigny J.-M. et C.M. Couillard (Éditeurs). Rapp. manus. sci. aquat. halieut. aquat., 2270: v + 118, pp. 65-76.
- TALBOT A., A. BOURGOIS et J.-M. SÉVIGNY (1994). Évaluation de l’exploitation du sébaste atlantique (Sebastes mentella) par la pêche sportive hivernale sur le fjord du Saguenay. Dans : Le fjord du Saguenay: un milieu exceptionnel de recherche.Sévigny J.-M. et C.M. Couillard (Éditeurs). Rapp. manus. sci. aquat. halieut. aquat., 2270, v + 118 p., pp. 77-82.
- THERRIAULT J.C., R. DE LADURANTAYE et R.G. INGRAM (1984). Particulate matter exchange across a fjord sill. Estuar. Coast. Shelf Sci., 18, 51-64.
- THRESHER R.E. (1999). Elemental composition of the otoliths as a stock delineator in fishes. Fish. Res., 43, 165‑204.
- URBANI N., J.-M. SÉVIGNY, B. SAINTE-MARIE, D. ZADWORNY et U. KUHNLEIN (1998). Identification of microsatellite markers in the snow crab Chionoecetes opilio. Mol. Ecol., 7, 357-363.
- VALENTIN A. (2006). Structure des populations de sébaste de l’Atlantique du nord-ouest dans un contexte de gestion des stocks et d’évolution. Thèse de Doctorat, Univ. du Québec à Rimouski, Canada, 212 p.
- VALENTIN A., J.-M. SÉVIGNY, D. POWER, R.M. BRANTON et B. MORIN (2006). Extensive sampling and concomitant use of meristic characteristics and variation at the MDH-A* locus reveal new information on redfish species distribution and spatial patterns introgressive hybridisation in the Northwest Atlantic. J. Northwest Atl. Fish. Sci., 36, 65-80.
- van OOSTERHOUT C., W.F. HUTCHINSON, D.P.M. WILLS et P. SHIPLEY (2004). MICROCHECKER: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data. Mol. Ecol. Notes, 4, 535-538.
- WEIR B.S. et C.C. COCKERHAM (1984). Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution, 38, 1358-1370.