Évaluation de maladies racinaires du soya dans des champs de la Montérégie en 2014 et 2015 Evaluation of fungal root diseases in soybean fields in Montérégie region in 2014 and 2015

Résumé

Un inventaire des maladies racinaires du soya causées par des champignons et des oomycètes a été réalisé en 2014 et 2015 dans 80 champs situés en Montérégie et 4 au Centre-du-Québec. Douze plantules au stade de deux feuilles trifoliées ont été prélevées par champ pour évaluer l’état sanitaire de leurs racines (indice racinaire) selon une échelle de 1 à 5 (1 = belles racines abondantes ; 5 = nécroses et peu de racines), et pour révéler dans ces racines, à l’aide de techniques de mise en culture, la présence de champignons et d’oomycètes pathogènes. L’indice racinaire moyen pour l’ensemble des champs était de 2,6 en 2014 et 3,2 en 2015. Des espèces de Pythium et de Fusarium étaient présentes dans presque 100 % des champs chaque année, alors que Rhizoctonia solani et Thielaviopsis basicola ont été plus abondants en 2015 (88 % des champs) qu’en 2014 (52 %). Phytophthora sojae n’a été isolé d’aucune racine, mais l’a été à partir des sols de 37 % des champs. Les espèces de Fusarium les plus fréquentes étaient F. solani, F. oxysporum et F. equiseti, présentes dans au moins 60 % des champs. La méthode d’analyse « stepwise » a sélectionné trois facteurs pour expliquer la variation de l’indice racinaire, dont deux ont montré des différences significatives entre leurs niveaux, soit le type de semence (indice plus élevé pour non-OGM que pour OGM) et le nombre d’années en culture de soya au cours des quatre dernières années (indice augmentant avec le nombre d’années). Le travail du sol a été le seul facteur sélectionné pour expliquer la variation des Fusarium totaux (somme diminuant avec l’intensité du travail de sol).

Mots-clés :

• inventaire,
• maladies,
• racines,
• soya,
• Glycine max,
• Fusarium spp.,
• Thielaviopsis basicola,
• Phytophthora sojae,
• Rhizoctonia solani,
• Pythium spp.,
• pratiques culturales

Abstract

A survey on soybean root diseases caused by fungi and oomycetes was conducted in 2014 and 2015 in 80 fields in Montérégie and 4 fields in Centre-du-Québec. Twelve seedlings at two-trifoliate-leaf stage were collected per field to assess their root health (root index) on a scale of 1 to 5 (1 = healthy abundant roots, 5 = necrosis and few roots), and to reveal in theses roots, by plating techniques, the presence of pathogenic fungi and oomycetes. The average root index for all fields was 2.6 in 2014 and 3.2 in 2015. Pythium and Fusarium species were present in almost 100% of the fields each year, while Rhizoctonia solani and Thielaviopsis basicola were more abundant in 2015 (88% of the fields) than in 2014 (52%). Phytophthora sojae was not isolated from any root, but was isolated from soils in 37% of the fields. The most common Fusarium species were F. solani, F. oxysporum and F. equiseti, found in at least 60% of the fields. The stepwise-analysis method selected three factors to explain the variation of root index, two of which showed significant differences between their levels, namely the type of seeds (higher index for non-GMOs than for GMOs). and the number of years in soybean crop over the past four years (index increasing with the number of years). Tillage was the only factor selected to explain the variation of the sum of Fusarium isolates (sum decreasing with the intensity of tillage).

Keywords:

• survey,
• root diseases,
• soybean,
• Glycine max,
• Fusarium spp.,
• Thielaviopsis basicola,
• Phytophthora sojae,
• Rhizoctonia solani,
• Pythium spp.,
• crop management